许可企业与普通企业的主要区别在于,许可企业需要获得相关部门的批准并申请营业执照,而普通企业则不需要。根据相关规定:企业登记机关必须凭许可机关颁发的批准文件和证书对批准的经营项目进行登记。批准文件、证书不代表授权工作事项或者表述不规范的,必须按照有关法律、行政法规、国务院决定和国发《国民经济行业分类》号的规定办理登记。公司注册处根据公司章程、合伙协议或公司申请,参照类别《国民经济行业分类》及相关规定,登记一般业务项目。不过,许可业务分为事前许可业务和事后许可业务。前置许可项目需经相关部门批准后方可申请危险化学品经营许可证、快递业务经营许可证、当铺经营许可证等营业执照。证后项目是指在申请食品经营许可证、烟草专卖许可证、互联网经营许可证、学校许可证等营业执照后,再申请营业执照的项目。